全区有水库3 座：华北河废段水库、永金水库、大兴水库。华北河废段水库1970年，因开挖永定新河，华北河被截，遂将下段故道(废河段)建成水库，即华北河废段水库。该水库位于境内东部，北起永定新河右堤，南至老华北河闸，长4.75千米。1976年被有关部门正式认定为小型水库，1988年始有华北河废段水库蓄水情况记载。1999年后，因该水库蓄水量逐年减少，其蓄水量未再见统计资料记载。

　　永金水库 1984年 4月 10日动工兴建，是年7 月20日工程告竣。该水库位于境内东部，永金引河西畔，占地207公顷，蓄水水源以区内地面径流为主，汛期利用淀南扬水站将丰产河沥水、新开河弃水和永金引河尾水调入水库。

　　大兴水库1985年 10月 5日开工建设，1986年 6月 10日竣工，该水库位于境内东部，北靠引滦明渠，南邻永定新河，占地300公顷。

　　1988年，3个水库总库容1880万立方米。1999—2004年，水库年末总蓄水量锐减，均在1000万立方米以下。2009年年末，区内水库蓄水600万立方米。2015年，区内水库总库容量1686万立方米。